本校区有18门硕士课程：

• 管理学
  
• 农学
  
• 建筑学
  
• 生物学
  
• 社会交往
  
• 图文传播设计
  
• 工业设计
  
• 经济学
  
• 护理学
  
• 口腔学
  
• 医学
  
• 兽医学
  
• 人类营养学
  
• 国土规划
  
• 政策与社会管理
  
• 心理学
  
• 生物制药化学
  
• 社会学

Xochimilco 校区于1974年11月开始从事学术活动，其教育模式（模块化系统）提出了对职业的重新社会定义，以及一种教与学体系的新思维和指导大学向社会变革方面的行动。

该校区院系有：

• 设计科学与设计艺术部（系）
  
• 生物科学与健康学部（系）
  
• 社会科学及人文学部（系）

还有24门研究生课程：

设计科学和设计艺术

• 设计科学和设计艺术硕士
  
• 设计与编辑制作硕士
  
• 建筑文物重新利用硕士
  
• 设计科学和设计艺术博士

生物科学和健康学部（系）

• 农牧业科学硕士
  
• 生物科学与健康学博士
  
• 公共卫生学博士
  
• 病理学和口腔医学专科、硕士
  
• 医药科学硕士
  
• 社会医学专科、硕士
  
• 神经康复学（儿童健康和发育后遗症预防领域）硕士
  
• 人口与健康专科（计划生育领域）
  
• 人口与健康硕士（计划生育领域）
  
• 职业健康科学硕士

社会科学和人文科学部（系）

• 经济法硕士
  
• 农村发展专业、硕士及博士学位
  
• 社会科学博士学位
  
• 教育发展和教育规划硕士
  
• 经济学和创新管理硕士
  
• 团体和机构社会心理学硕士
  
• 妇女研究硕士、专科
  
• 公共政策硕士
  
• 通信与政治学硕士
  
• 经济学硕士和博士学位